Andmed

Analüüsis kasutasime Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu (TÜ EGV, \(n \approx 50000\)) ja UK Biopanga (UKB, \(n \approx 400000\)) geenidoonorite andmeid.

Koopiaarvu variatsioonide andmestik

CNV-d on TÜ EGV ja UKB geenidoonoritele leitud PennCNV programmi abil. Analüüsi läbiviimise jaoks kasutatakse CNV-de kohta järgmisi tunnuseid:

CNV-d kandva indiviidi kood;
kromosoom, millel CNV asub;
CNV alguskoordinaat kromosoomil;
CNV lõppkoordinaat kromosoomil;
koopiaarv (deletsiooni korral 0 või 1 ning duplikatsiooni korral 3 või 4);
CNV kvaliteediskoor.

Ravimi kõrvaltoimete andmestik

Ravimite kõrvaltoimed on tähistatud ICD-10-koodide (rahvusvahelise haiguste klassifikatsiooni kümnes versioon) abil.

TÜ EGV geenidoonorite ravimite kõrvaltoimete andmestik on kokku pandud info põhjal, mis on pärit doonorite enda täidetud küsimustikest, Eesti Haigekassa retseptidest, Tartu Ülikooli Kliinikumist, Põhja-Eesti Regionaalhaiglast, E-tervise andmetest ning surma- ja vähiregistrist.

Terviseregistrite andmed on olemas ka UKB geenidoonorite jaoks.